人参、灵芝、枸杞等药食同源植物发酵后的特别价值，在于把原本需要肠道菌群转化、皮肤难以直接利用的大分子糖苷，提前在发酵罐中转化为苷元与小分子片段。
机理可以分三层看：一是糖苷转化，人参中的主要皂苷多为糖苷型，微生物糖苷水解酶可切除部分糖基得到稀有皂苷或苷元；二是破壁与溶出，灵芝子实体与孢子细胞壁结构致密，发酵与破壁结合有助于提高多糖与三萜的释放；三是黏度与分子形态改善，枸杞等富含多糖的底物经部分降解为低聚糖后，黏度下降、更易配方化。此外，发酵还会生成有机酸、多肽等新的代谢产物，并在一定程度上改善色泽与气味。
客观地说，转化程度视菌种、底物与工艺条件而定，不同体系之间差异很大，不存在统一的转化率。
优科观察：药食同源不等于化妆品免检，植物原料仍须完成安全评估并按《化妆品安全技术规范》控制农残、重金属与微生物。原料层面的成分变化不等于成品功效。