两条路都存在，但真正用于产业化的菌株通常走「从合法保藏机构获取出发菌株，再做自主适应性选育」的组合路线。直接从保藏库取一株标准菌株投入生产，很难同时满足安全性、产率与底物适配三项要求。
原因在于分工不同：公开保藏机构的价值在于提供来源清晰、可追溯、有安全使用记录的出发菌株，解决的是「起点合法」问题；但标准菌株多是为科研或食品发酵优化的，其底物谱、产物得率与化妆品原料的目标并不一致，尤其面对植物基质这类复杂底物时，往往生长缓慢、转化能力不足。
因此企业会在出发菌株的基础上做定向筛选与适应性驯化，包括耐底物抑制物驯化、产物谱优选和工业条件耐受性选育，最终形成自有生产菌株。优科与齐鲁工业大学（山东省科学院）、中国科学院长春应化研究所等共建联合研发平台，筛选工作即在此框架下开展。出于知识产权与生物安全考虑，具体菌株编号与保藏信息不对外披露，但应向客户提供可追溯的菌种来源说明与安全性资料。